免疫器官是淋巴细胞和其他免疫细胞产生、分化、成熟、定居、增殖以及产生免疫应答的场所。按其功能不同分为中枢免疫器官和周围免疫器官。两类免疫器官通过血液和淋巴液的循环相互联结。

1.中枢免疫器官　中枢免疫器官是免疫细胞产生、分化和成熟的场所。人类和哺乳动物的中枢免疫器官主要是胸腺和骨髓，鸟类还包括腔上囊。

（1）骨髓　骨髓是造血组织，也是各种免疫细胞产生和分化的场所。骨髓中的多能干细胞在骨髓基质细胞产生的细胞因子作用下，首先分化成髓样干细胞和淋巴干细胞，前者进一步分化成红细胞系、粒细胞系和单核细胞系；后者则发育为各种淋巴细胞的前体细胞。一部分淋巴干细胞分化为T细胞的前体细胞，经血液循环到达胸腺中枢器官发育为成熟的T细胞；另一部分淋巴干细胞分化为B细胞的前体细胞，继续在骨髓内分化发育为成熟的B细胞。在鸟类，腔上囊为B细胞成熟的场所。

（2）胸腺　胸腺是人体的淋巴样器官，位于胸腔，由两叶组成。幼年时，腺体逐渐增大，至青春期时质量可达30～40 g。随年龄增长逐渐退化。胸腺主要由淋巴细胞和上皮性网状细胞构成。胸腺的淋巴细胞又名T淋巴细胞或T细胞，它是由骨髓的造血淋巴干细胞经血流进入胸腺后，在胸腺素的诱导下经过分裂、增生、分化而成的，然后随血流送到脾脏淋巴结等淋巴器官的胸腺依赖区，参与免疫作用。上皮性网状细胞则分泌胸腺素。

2.外周免疫器官　外周免疫器官是成熟的T细胞和B细胞定居的场所，也是这些细胞接受抗原刺激后发生免疫应答的部位。外周免疫器官包括淋巴结、脾、黏膜相关组织及皮肤相关淋巴组织。

（1）淋巴结　淋巴结由被膜和实质组成，实质可区分为皮质和髓质两部分。内含75%的T淋巴细胞，25%的B淋巴细胞。皮质由浅皮质区和深皮质区构成，浅皮质区中含有淋巴小结，主要有B细胞分布。抗原刺激后，此处的B细胞分裂增殖形成生发中心，内含不同分化阶段的B细胞和浆细胞。浅皮质区因主要由B细胞定居，故称非胸腺依赖区。深皮质区为弥散淋巴组织，主要由T细胞定居，故亦称胸腺依赖区。皮质区还有树突状细胞和巨噬细胞。髓质中的髓索内主要有B细胞和巨噬细胞，受抗原刺激后可形成大量浆细胞，因此是抗体合成和分泌的部位。巨噬细胞具有清除细菌、毒素、癌细胞等有害物质及处理抗原的作用。另外，深皮质区的毛细血管后小静脉由高立方形内皮细胞组成，来自血液的淋巴细胞可穿过此内皮细胞进入淋巴结实质，再回到淋巴液中，实现淋巴细胞再循环。

（2）脾　脾是人类最大的免疫器官，由被膜、白髓、红髓及大量血窦构成。白髓中央动脉周围淋巴鞘主要有T细胞分布，占脾淋巴细胞的40%。白髓的淋巴小结和红髓的髓索内主要有B细胞分布，占脾淋巴细胞的60%。受抗原刺激后，B细胞分化为浆细胞，产生抗体。脾中含有大量的巨噬细胞，可吞噬和清除血液中的细菌等有害异物及衰老的血细胞。

（3）其他淋巴组织　其他淋巴组织主要分布在黏膜部位，如肠道黏膜集合淋巴结、扁桃体、阑尾、消化道、呼吸道和泌尿生殖道黏膜下层的淋巴小结和弥散淋巴组织，亦称黏膜相关淋巴组织，均含丰富的淋巴细胞和巨噬细胞。抗原进入后，可刺激黏膜局部的B细胞增殖分化成浆细胞，产生分泌型IgA，具有重要的局部抗感染作用。