真菌是一大类具有典型细胞核的真核细胞型微生物。细胞核高度分化，有核膜和核仁，胞浆内有完整的细胞器，细胞壁由几丁质或纤维素组成。但是真菌不含叶绿素。除少数为单细胞外，大部分真菌为多细胞结构。

真菌以腐生或寄生方式生存，按有性或无性方式进行繁殖。在自然界分布广泛。且种类繁多，数量大，有12万种之多。其中绝大多数对人类有益，如酿酒、发酵、生产抗生素等。对人类致病的仅百余种，能引起人类感染性、中毒性及超敏反应性疾病，甚至引发肿瘤。近年来真菌感染明显上升，这与滥用抗生素引起菌群失调和应用激素、抗癌药物导致免疫力低下有关，也引起医学界的高度重视。

真菌的形态多种多样，小到肉眼看不见，如新型隐球菌、白色念珠菌等；大如碗、盆，如木耳、蘑菇等。结构比细菌复杂，胞壁不含肽聚糖，多由糖苷、糖蛋白、蛋白质和几丁质4层结构组成。

真菌按形态可分为单细胞和多细胞真菌两类。单细胞真菌呈圆形或卵圆形，称酵母菌。多细胞真菌大多长出菌丝与孢子，交织成团，称丝状菌，又称霉菌。有些真菌可因环境条件（如营养、温度、氧气等）的改变，两种形态可以互变，称为二相性。如球孢子菌、组织胞浆菌和孢子丝菌等。

医学上按真菌感染部位的不同，一般分为浅部感染真菌和深部感染真菌两类。