前列腺素是一类具有廿碳原子的不饱和脂肪酸，以前列腺酸为基本骨架，具有一个五碳和两条侧链（R1和R2）。

根据五碳环上取代基团和双键位置不同，PG分为9型，分别命名为PGA、PGB、PGC、PGD、PGE、PGF、PGG、PGH及PGI，体内PGA、PGE及PGF较多。PGG2和PGH2是PG合成过程中的中间物，在C-9和C-11之间有过氧化键相连。PGI2是带双环的PG，除五碳环外，还有一个含氧的五碳环，因此又称为前列腺环素。前列腺素中第9位碳原子上的羟基有两种立体构型。OH基位于五碳环平面之下为α-型，用虚线连接，位于平面之上为β-型，用实线表示。天然前列腺素均为α-型，不存在β-型。

根据其R1和R2两条侧链中双键数目的多少，PG又分为1、2、3类，在字母的右下角标示。

血栓素也是廿碳不饱和脂肪酸的衍生物，它有前列腺酸样骨架但又不相同，分子中的五碳环为含氧的烷所取代。

白三烯是不含前列腺酸骨架的廿碳多不饱和脂酸。一般LT有4个双键，所以在LT字母的右下方标以4。LT合成的初级产物为LTA4。在5，6位上有一氧环。如在12位加水引入羟基，并将5，6位的环氧键断裂，则为LTB4，如LTA4的5，6环氧键打开，在6位与谷胱甘肽反应则生成LTC4、LTD4及LTE4等衍生物。过敏反应的慢反应物质（SRS-A），现已证明就是后三者的混合物。