膳食中的脂类主要为脂肪，此外还含少量磷脂、胆固醇等。脂类不溶于水，必须在肠中经胆汁中胆汁酸盐的作用，乳化并分散成细小的微团后，才能被消化酶消化。胰液及胆汁均分泌入十二指肠，因此小肠上段是脂类消化的主要场所。胆汁酸盐是较强的乳化剂，能降低油与水相之间的界面张力，使脂肪及胆固醇酯等疏水的脂质乳化成细小微团，增加消化酶对脂质的接触面积，有利于脂肪及类脂的消化及吸收。胰腺分泌入十二指肠中消化脂类的酶有胰脂酶、磷脂酶A2、胆固醇酯酶及辅脂酶。

经上述各种酶分解所得的消化产物，包括甘油一酯、脂肪酸、胆固醇及溶血磷脂等可与胆汁酸盐作用，乳化成更小的混合微团。这种微团体积更小（直径约为20 nm），极性更大，易于穿过小肠黏膜细胞表面的水屏障，为肠黏膜细胞吸收。

脂类消化产物主要在十二指肠下段及空肠上段吸收。中链脂肪酸（C6～C10）及短链脂肪酸（C2～C4）构成的三酰甘油，经胆汁酸盐乳化后即可被吸收，在肠黏膜细胞内脂肪酶的作用下，水解为脂肪酸及甘油，通过门静脉进入血循环。长链脂肪酸（C12～C26）经一系列变化也形成乳糜微粒进入血循环。也有少量先进入肝，再由肝进入血液，由血液运至全身各组织器官。