各种营养物质通过肠黏膜上皮细胞或细胞间质进入血液和淋巴液的方式包括单纯扩散、易化扩散、主动转运、入胞和出胞等，糖和蛋白质的分解产物以及水和电解质直接进入血液。脂肪的分解产物中的短、中链脂肪酸直接进入血液，长链脂肪酸、甘油一酯则在胆盐的帮助下，先进入淋巴，再进入血液。膳食中的脂肪含长链脂肪酸较多，所以脂肪的吸收途径以淋巴为主。

在小肠内，糖类、蛋白质和脂肪的消化产物以及水和无机盐等主要在十二指肠和空肠被吸收，维生素B12和胆盐主要在回肠被吸收。